Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 CT009480.1-201ENSMUST00000225771 4480 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm26257-201ENSMUST00000122500 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm25821-201ENSMUST00000093657 133 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Kbtbd8-201ENSMUST00000032107 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm28669-201ENSMUST00000188400 100 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm28267-201ENSMUST00000191093 265 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 AC155923.1-201ENSMUST00000215676 356 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Tom1l1-201ENSMUST00000020849 4308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd11P23813 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm25524-201ENSMUST00000101821 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm25798-201ENSMUST00000082641 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Olfr393-202ENSMUST00000213365 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Olfr1322-202ENSMUST00000217355 3886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm11939-201ENSMUST00000104931 300 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm25606-201ENSMUST00000158363 95 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Olfr213-202ENSMUST00000220008 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd11P23813 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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