Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm24268-201ENSMUST00000082990 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
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Ccl20O89093 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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Ccl20O89093 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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Ccl20O89093 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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Ccl20O89093 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
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Ccl20O89093 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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