Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ArxO35085 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ArxO35085 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm7449-201ENSMUST00000194393 663 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ArxO35085 Calml4-203ENSMUST00000213643 710 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ArxO35085 AC153361.1-201ENSMUST00000219679 247 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm3338-201ENSMUST00000220982 269 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ArxO35085 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ArxO35085 Olfr1490-201ENSMUST00000080162 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm13630-201ENSMUST00000127849 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ArxO35085 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ArxO35085 Vmn1r185-212ENSMUST00000228633 5385 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ArxO35085 AC124572.2-201ENSMUST00000218041 5152 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ArxO35085 Hfm1-202ENSMUST00000117588 4870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ArxO35085 Syne1-205ENSMUST00000215295 27908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ArxO35085 Vwc2l-203ENSMUST00000161937 4323 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ArxO35085 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm14649-201ENSMUST00000121814 324 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ArxO35085 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm22968-201ENSMUST00000157955 118 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ArxO35085 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm44864-201ENSMUST00000207292 505 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ArxO35085 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ArxO35085 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ArxO35085 Olfr986-203ENSMUST00000216720 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ArxO35085 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ArxO35085 Traj12-201ENSMUST00000103729 58 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ArxO35085 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ArxO35085 n-R5s152-201ENSMUST00000093641 119 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ArxO35085 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 St8sia4-204ENSMUST00000189556 10027 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 4932415D10Rik-202ENSMUST00000217661 15111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm15553-201ENSMUST00000118757 430 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm10059-201ENSMUST00000131139 171 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 Olfr993-201ENSMUST00000099926 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 AC121997.2-203ENSMUST00000228613 4192 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ArxO35085 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ArxO35085 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ArxO35085 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ArxO35085 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ArxO35085 Olfr1270-202ENSMUST00000213946 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ArxO35085 Abi3bp-204ENSMUST00000171000 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ArxO35085 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ArxO35085 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ArxO35085 Olfr933-202ENSMUST00000216238 4475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm22269-201ENSMUST00000104002 130 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ArxO35085 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm14303-201ENSMUST00000121320 171 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm25386-201ENSMUST00000157814 288 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm22536-201ENSMUST00000158171 134 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ArxO35085 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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