Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.5 ms