Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 AC159231.1-201ENSMUST00000225365 226 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm24705-201ENSMUST00000082808 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm37412-201ENSMUST00000194866 4321 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Mir6537-201ENSMUST00000184150 110 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm29574-201ENSMUST00000186226 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 1700027A15Rik-203ENSMUST00000188793 423 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Cntn6-201ENSMUST00000089215 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm6205-202ENSMUST00000190001 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm15926-201ENSMUST00000120492 550 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm27733-201ENSMUST00000184803 68 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm4035-202ENSMUST00000190684 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm43735-201ENSMUST00000198245 809 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm43001-202ENSMUST00000199076 192 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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Limd1Q9QXD8 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Vmn2r23-201ENSMUST00000172391 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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Limd1Q9QXD8 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm37397-201ENSMUST00000194579 2842 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm22758-201ENSMUST00000102275 96 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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