Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Tas2r139-201ENSMUST00000057686 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm26701-201ENSMUST00000181571 234 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm22340-201ENSMUST00000157717 114 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm22575-201ENSMUST00000082981 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm14591-201ENSMUST00000120407 518 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm38353-201ENSMUST00000192351 617 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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