Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn19Q9ET38 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210.7 ms