Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms