Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Olfr580-ps1-201ENSMUST00000210528 943 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm27607-201ENSMUST00000185162 122 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm45502-201ENSMUST00000209561 252 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm24323-201ENSMUST00000175342 77 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccdc18Q640L5 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm25497-201ENSMUST00000104425 132 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm23151-201ENSMUST00000178061 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Olfr183-203ENSMUST00000213465 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Mir3109-201ENSMUST00000175301 88 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm38353-201ENSMUST00000192351 617 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm24579-201ENSMUST00000103964 144 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccdc18Q640L5 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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