Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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