Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 A630033H20Rik-205ENSMUST00000167673 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12335-201ENSMUST00000119738 327 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14687-201ENSMUST00000120206 363 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 AC136976.1-201ENSMUST00000221440 381 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18921-201ENSMUST00000221798 366 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 C130023A14Rik-201ENSMUST00000193537 3087 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12902-201ENSMUST00000118389 322 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1369-ps1-204ENSMUST00000215207 3794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Syne2-210ENSMUST00000143031 21704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37777-201ENSMUST00000195546 3366 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms