Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Cpne9Q1RLL3 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms