Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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Ggta1P23336 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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Ggta1P23336 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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Ggta1P23336 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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Ggta1P23336 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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Ggta1P23336 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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Ggta1P23336 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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Ggta1P23336 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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Ggta1P23336 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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Ggta1P23336 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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Ggta1P23336 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
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Ggta1P23336 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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Ggta1P23336 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ggta1P23336 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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