Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccl20O89093 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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Ccl20O89093 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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Ccl20O89093 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccl20O89093 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccl20O89093 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccl20O89093 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccl20O89093 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccl20O89093 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccl20O89093 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccl20O89093 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccl20O89093 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccl20O89093 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccl20O89093 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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Ccl20O89093 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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Ccl20O89093 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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Ccl20O89093 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccl20O89093 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccl20O89093 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
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Ccl20O89093 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
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Ccl20O89093 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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Ccl20O89093 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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Ccl20O89093 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
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