Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm43268-201ENSMUST00000201536 4055 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm12806-201ENSMUST00000119384 268 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn4O35054 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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