Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Casq1O09165 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Casq1O09165 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
Casq1O09165 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Casq1O09165 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Casq1O09165 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Casq1O09165 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Casq1O09165 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Casq1O09165 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Casq1O09165 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Casq1O09165 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Casq1O09165 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms