Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Olfr901-203ENSMUST00000216644 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm12374-201ENSMUST00000147108 3299 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 4931408C20Rik-201ENSMUST00000097801 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Olfr1167-202ENSMUST00000216951 4276 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Pramel6-202ENSMUST00000111572 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Clec1b-203ENSMUST00000112081 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm13092-201ENSMUST00000136346 260 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Scgb2b28-ps-201ENSMUST00000188974 337 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm18441-201ENSMUST00000223539 617 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm21033-201ENSMUST00000208590 2608 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm9343-201ENSMUST00000209016 2609 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Ccr2-201ENSMUST00000055918 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm15493-201ENSMUST00000119461 528 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm22453-201ENSMUST00000122801 318 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm43649-201ENSMUST00000196596 391 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm10491-201ENSMUST00000085330 117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Vmn1r89-208ENSMUST00000228587 2061 ntAPPRIS P2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Pign-201ENSMUST00000070699 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Ddx60-202ENSMUST00000093485 5989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm22107-201ENSMUST00000122548 100 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Trav7-5-201ENSMUST00000200609 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm43441-201ENSMUST00000201458 205 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 n-R5s162-201ENSMUST00000082581 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Mir383-201ENSMUST00000083523 70 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm28362-201ENSMUST00000189430 2420 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm4788-202ENSMUST00000111986 2935 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm32444-201ENSMUST00000195147 3511 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Tom1l1-201ENSMUST00000020849 4308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm12708-201ENSMUST00000126143 349 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Limd1Q9QXD8 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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