Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm13860-201ENSMUST00000125185 452 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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