Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn19Q9ET38 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms