Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Vipas39Q8BGQ1 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Vipas39Q8BGQ1 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Vipas39Q8BGQ1 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Vipas39Q8BGQ1 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Vipas39Q8BGQ1 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Vipas39Q8BGQ1 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Vipas39Q8BGQ1 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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Vipas39Q8BGQ1 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Vipas39Q8BGQ1 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Vipas39Q8BGQ1 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Vipas39Q8BGQ1 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Vipas39Q8BGQ1 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Vipas39Q8BGQ1 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Vipas39Q8BGQ1 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Vipas39Q8BGQ1 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
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Vipas39Q8BGQ1 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Vipas39Q8BGQ1 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Vipas39Q8BGQ1 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Vipas39Q8BGQ1 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm25294-201ENSMUST00000122791 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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Vipas39Q8BGQ1 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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Vipas39Q8BGQ1 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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Vipas39Q8BGQ1 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
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Vipas39Q8BGQ1 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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Vipas39Q8BGQ1 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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Vipas39Q8BGQ1 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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Vipas39Q8BGQ1 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1114-ps1-201ENSMUST00000213896 456 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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