Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 AC153887.2-201ENSMUST00000219160 3838 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm23530-201ENSMUST00000104564 137 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Mir5127-201ENSMUST00000175295 71 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm28141-201ENSMUST00000186676 342 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm45159-201ENSMUST00000208630 25241 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 AC161254.1-201ENSMUST00000220310 3842 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Cln5Q3UMW8 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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Cln5Q3UMW8 Gm23592-201ENSMUST00000157859 117 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Cln5Q3UMW8 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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Cln5Q3UMW8 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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Cln5Q3UMW8 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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Cln5Q3UMW8 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm28591-201ENSMUST00000185259 183 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln5Q3UMW8 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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