Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm25022-201ENSMUST00000102205 83 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm13667-201ENSMUST00000132332 617 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Mir467a-6-201ENSMUST00000177790 83 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Mir467a-3-201ENSMUST00000178082 83 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Mir467a-7-201ENSMUST00000178635 83 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm24567-201ENSMUST00000179294 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Mir467a-10-201ENSMUST00000179320 83 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Mir467a-5-201ENSMUST00000179352 83 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Mir467a-2-201ENSMUST00000179447 83 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Mir467a-9-201ENSMUST00000179752 83 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Mir467a-4-201ENSMUST00000179923 83 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Mir467a-8-201ENSMUST00000180070 83 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm25228-201ENSMUST00000180121 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm23304-201ENSMUST00000180209 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm27733-201ENSMUST00000184803 68 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm29097-201ENSMUST00000190273 422 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm25684-201ENSMUST00000083941 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Olfr1178-202ENSMUST00000214040 6480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Olfr186-202ENSMUST00000206463 2208 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 1700126H18Rik-201ENSMUST00000201903 405 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 AC107864.1-201ENSMUST00000217937 496 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 AC160962.3-201ENSMUST00000225914 112 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Rpl32-ps-201ENSMUST00000091052 506 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Hm629797-201ENSMUST00000183645 2398 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Rgs5-201ENSMUST00000027997 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 AC115034.1-201ENSMUST00000215393 3846 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms