Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Olfr916-201ENSMUST00000081196 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cpne9Q1RLL3 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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