Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm13478-201ENSMUST00000118312 413 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm12252-201ENSMUST00000119517 219 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm14649-201ENSMUST00000121814 324 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Mir6345-201ENSMUST00000184286 128 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm28500-201ENSMUST00000190286 151 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm43441-201ENSMUST00000201458 205 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm44521-201ENSMUST00000206469 217 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Ccl5-201ENSMUST00000035938 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm21033-201ENSMUST00000208590 2608 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm9343-201ENSMUST00000209016 2609 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Olfr1042-202ENSMUST00000215624 5096 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Olfr1323-203ENSMUST00000213556 5431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Hfm1-202ENSMUST00000117588 4870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Nlrp4d-201ENSMUST00000182420 2946 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Arrdc3-201ENSMUST00000099356 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Nebl-202ENSMUST00000124270 8079 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Igkv5-45-201ENSMUST00000103366 385 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 1700027A15Rik-203ENSMUST00000188793 423 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm43730-201ENSMUST00000199863 372 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Olfr542-ps1-201ENSMUST00000211706 831 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Erbin-207ENSMUST00000191275 5552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm14015-201ENSMUST00000130634 3949 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Xrn1-202ENSMUST00000185633 10256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Olfr263-202ENSMUST00000215804 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Btbd35f10-201ENSMUST00000178621 1952 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Olfr1058-202ENSMUST00000213998 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Agtr2-201ENSMUST00000089188 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Uty-205ENSMUST00000143286 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm42717-201ENSMUST00000197309 3463 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Pak3-201ENSMUST00000033640 8348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm1968-201ENSMUST00000100016 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm15926-201ENSMUST00000120492 550 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm11958-201ENSMUST00000127224 253 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm26001-201ENSMUST00000157989 103 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm19503-201ENSMUST00000187109 241 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm28267-201ENSMUST00000191093 265 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm43424-201ENSMUST00000200484 253 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm18441-201ENSMUST00000223539 617 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Snord47-201ENSMUST00000083034 77 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm22973-201ENSMUST00000083298 191 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.8 ms