Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm12806-201ENSMUST00000119384 268 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm28241-201ENSMUST00000190916 235 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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