Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Gm25967-201ENSMUST00000157168 147 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Gm23260-201ENSMUST00000158317 172 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Gm24636-201ENSMUST00000158673 288 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Gm2862-201ENSMUST00000161524 328 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpreP49446 1700112M02Rik-201ENSMUST00000221719 348 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Oog2-201ENSMUST00000080405 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Gm36259-201ENSMUST00000197340 392 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpreP49446 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpreP49446 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpreP49446 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpreP49446 AC154462.1-201ENSMUST00000228897 2260 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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PtpreP49446 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm14303-201ENSMUST00000121320 171 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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PtpreP49446 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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PtpreP49446 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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PtpreP49446 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Mir383-201ENSMUST00000083523 70 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpreP49446 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpreP49446 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Olfr1197-202ENSMUST00000213118 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpreP49446 A830011K09Rik-202ENSMUST00000162868 2201 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm38152-201ENSMUST00000195389 3566 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm43913-201ENSMUST00000203924 3029 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpreP49446 Gm25386-201ENSMUST00000157814 288 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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