Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Olfr898-202ENSMUST00000216304 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Snhg14-207ENSMUST00000188162 770 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Mir5117-201ENSMUST00000083226 84 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm25205-201ENSMUST00000082841 103 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Mir713-201ENSMUST00000178651 108 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm27189-201ENSMUST00000184119 190 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm831-201ENSMUST00000149942 4517 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms