Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Casq1O09165 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Casq1O09165 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Tas2r114-201ENSMUST00000080619 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Casq1O09165 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Casq1O09165 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm17154-201ENSMUST00000165748 431 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Casq1O09165 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Casq1O09165 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Casq1O09165 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms