Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.54□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atp8b5A3FIN4 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
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