Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Col5a3Q9JLI2 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.9 ms