Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prpf39Q8K2Z2 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm26393-201ENSMUST00000157625 129 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.9 ms