Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Olfr867-203ENSMUST00000216538 4617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm23126-201ENSMUST00000104260 134 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm22340-201ENSMUST00000157717 114 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
Ccdc18Q640L5 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Gm14879-201ENSMUST00000117308 507 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc18Q640L5 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms