Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Mir466-201ENSMUST00000093591 73 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Fat3-205ENSMUST00000217308 18760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm26171-201ENSMUST00000158422 131 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Olfr91-203ENSMUST00000217372 3809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm28362-201ENSMUST00000189430 2420 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Olfr905-202ENSMUST00000214377 4429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Tmc4-ps-201ENSMUST00000117819 258 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm22070-201ENSMUST00000178475 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm28118-201ENSMUST00000185957 294 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Olfr787-202ENSMUST00000213329 4958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm5762-201ENSMUST00000119204 258 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Smcp-202ENSMUST00000194965 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Rpl18a-ps2-201ENSMUST00000197158 174 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm43735-201ENSMUST00000198245 809 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm44871-201ENSMUST00000207821 497 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Fth-ps3-201ENSMUST00000210405 358 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm22950-201ENSMUST00000082776 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf40Q3U319 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms