Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm8473-201ENSMUST00000176697 1885 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Prlr-205ENSMUST00000128921 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm23671-201ENSMUST00000157472 103 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm39147-201ENSMUST00000211376 465 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Mir21a-201ENSMUST00000083521 92 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.8 ms