Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RxraP28700 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RxraP28700 Olfr609-203ENSMUST00000216360 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RxraP28700 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RxraP28700 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RxraP28700 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RxraP28700 Snhg14-207ENSMUST00000188162 770 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RxraP28700 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RxraP28700 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RxraP28700 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RxraP28700 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RxraP28700 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RxraP28700 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RxraP28700 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Olfr1309-202ENSMUST00000214537 4274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm25727-201ENSMUST00000104522 131 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 AC160865.1-201ENSMUST00000219873 151 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RxraP28700 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
RxraP28700 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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