Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm23630-201ENSMUST00000175292 104 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm42451-201ENSMUST00000197410 244 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 2410024N13Rik-201ENSMUST00000090704 669 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Olfr125-202ENSMUST00000213857 3835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Zzz3-202ENSMUST00000106100 7607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Mir802-201ENSMUST00000103258 97 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm28702-201ENSMUST00000188276 253 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm42909-201ENSMUST00000196982 3619 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Vmn2r26-201ENSMUST00000032238 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Slc6a18-203ENSMUST00000109680 4052 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gprasp1-206ENSMUST00000166554 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Acad11-201ENSMUST00000047799 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm24281-201ENSMUST00000104234 136 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm24199-201ENSMUST00000157808 136 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd11P23813 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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