Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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Ccl20O89093 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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Ccl20O89093 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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Ccl20O89093 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
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Ccl20O89093 Olfr934-202ENSMUST00000214324 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
Ccl20O89093 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
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Ccl20O89093 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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Ccl20O89093 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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Ccl20O89093 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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Ccl20O89093 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccl20O89093 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccl20O89093 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccl20O89093 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccl20O89093 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccl20O89093 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccl20O89093 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccl20O89093 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccl20O89093 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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