Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm11645-201ENSMUST00000121589 649 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Abi3bp-204ENSMUST00000171000 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Olfr112-201ENSMUST00000085548 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 AC162934.1-201ENSMUST00000222880 309 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 AC126253.2-201ENSMUST00000226518 205 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 n-R5s220-201ENSMUST00000082926 120 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Vmn1r42-203ENSMUST00000227279 4138 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Fsd1l-207ENSMUST00000180164 7340 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Olfr1033-204ENSMUST00000215682 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Igkv8-30-201ENSMUST00000103378 368 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Gm21887J3QQ04 Gm13478-201ENSMUST00000118312 413 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms