Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm23126-201ENSMUST00000104260 134 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm24445-201ENSMUST00000083981 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm26701-201ENSMUST00000181571 234 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm14041-201ENSMUST00000150181 276 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm24323-201ENSMUST00000175342 77 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
Ddx60E9PZQ1 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ddx60E9PZQ1 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ddx60E9PZQ1 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddx60E9PZQ1 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddx60E9PZQ1 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddx60E9PZQ1 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddx60E9PZQ1 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddx60E9PZQ1 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddx60E9PZQ1 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddx60E9PZQ1 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddx60E9PZQ1 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddx60E9PZQ1 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddx60E9PZQ1 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddx60E9PZQ1 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddx60E9PZQ1 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddx60E9PZQ1 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Ddx60E9PZQ1 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ddx60E9PZQ1 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ddx60E9PZQ1 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms