Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm9818-201ENSMUST00000050900 255 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm44142-201ENSMUST00000203358 311 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Mir21a-201ENSMUST00000083521 92 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm12806-201ENSMUST00000119384 268 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Grik3B1AS29 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms