Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm45235-201ENSMUST00000208016 4465 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm37478-201ENSMUST00000193624 3495 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm23905-201ENSMUST00000157568 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Rpl31-ps24-201ENSMUST00000181350 379 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm27940-201ENSMUST00000184449 98 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 1700121L16Rik-201ENSMUST00000189166 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Rpl36a-ps2-201ENSMUST00000197973 321 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm43604-201ENSMUST00000199799 705 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm13419-201ENSMUST00000121711 271 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm23638-201ENSMUST00000175073 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm23158-201ENSMUST00000175076 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm22907-201ENSMUST00000175198 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm22625-201ENSMUST00000175382 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm22875-201ENSMUST00000175449 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm25197-201ENSMUST00000175516 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm27857-201ENSMUST00000176930 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm26268-201ENSMUST00000177685 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm23681-201ENSMUST00000178821 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 CT009711.3-201ENSMUST00000225882 250 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Ccl5-201ENSMUST00000035938 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 4932431L22Rik-201ENSMUST00000193456 3140 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Fancb-201ENSMUST00000057150 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm42616-201ENSMUST00000198989 4184 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Oog2-201ENSMUST00000080405 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Limd1Q9QXD8 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm23789-201ENSMUST00000122536 301 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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Limd1Q9QXD8 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Macc1-201ENSMUST00000048880 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm23138-201ENSMUST00000083365 103 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Aspn-202ENSMUST00000177948 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Olfr669-202ENSMUST00000210138 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Olfr112-204ENSMUST00000208832 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Olfr213-202ENSMUST00000220008 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Limd1Q9QXD8 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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