Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Themis-202ENSMUST00000060409 2278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm44682-201ENSMUST00000208501 2614 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Olfr213-202ENSMUST00000220008 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm10964-201ENSMUST00000106852 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Clec1b-203ENSMUST00000112081 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm24750-201ENSMUST00000157843 104 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm27457-201ENSMUST00000184771 156 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 CT009711.3-201ENSMUST00000225882 250 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Snord47-201ENSMUST00000083034 77 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Olfr44-202ENSMUST00000215065 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Olfr694-204ENSMUST00000216895 4853 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm42717-201ENSMUST00000197309 3463 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm11479-201ENSMUST00000134275 387 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm43441-201ENSMUST00000201458 205 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Hfm1-201ENSMUST00000112690 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Syne1-205ENSMUST00000215295 27908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Olfr646-202ENSMUST00000214099 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r62-201ENSMUST00000173956 1757 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps49-201ENSMUST00000173160 3551 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm28924-201ENSMUST00000190012 241 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm44389-201ENSMUST00000203795 182 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm19908-201ENSMUST00000204684 391 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Olfr542-ps1-201ENSMUST00000211706 831 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 AC074315.1-201ENSMUST00000228801 214 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Mir202-201ENSMUST00000083568 72 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm5127-202ENSMUST00000101297 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Olfr1028-201ENSMUST00000080698 3474 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r215-202ENSMUST00000228092 2790 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Olfr810-204ENSMUST00000217283 4527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm15058-201ENSMUST00000117689 458 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm37431-201ENSMUST00000195102 111 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Gm10491-201ENSMUST00000085330 117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Olfr1356-202ENSMUST00000205100 3023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rabgef1Q9JM13 Agtr2-201ENSMUST00000089188 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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