Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 AC134254.5-201ENSMUST00000223436 400 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm15001-201ENSMUST00000117657 795 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 n-R5s196-201ENSMUST00000083136 117 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Olfr867-203ENSMUST00000216538 4617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm13359-201ENSMUST00000119000 695 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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