Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm24096-201ENSMUST00000103905 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm26701-201ENSMUST00000181571 234 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm37692-201ENSMUST00000192633 232 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 BC051076-202ENSMUST00000199477 2868 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Olfr1030-201ENSMUST00000056849 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Vmn1r42-203ENSMUST00000227279 4138 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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