Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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Trim38Q5SZ99 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 Olfr908-201ENSMUST00000215139 932 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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Trim38Q5SZ99 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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Trim38Q5SZ99 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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Trim38Q5SZ99 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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Trim38Q5SZ99 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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Trim38Q5SZ99 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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Trim38Q5SZ99 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim38Q5SZ99 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
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Trim38Q5SZ99 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim38Q5SZ99 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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Trim38Q5SZ99 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim38Q5SZ99 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim38Q5SZ99 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim38Q5SZ99 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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Trim38Q5SZ99 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim38Q5SZ99 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim38Q5SZ99 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim38Q5SZ99 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim38Q5SZ99 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim38Q5SZ99 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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