Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1216-202ENSMUST00000216000 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm26129-201ENSMUST00000082719 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm43899-201ENSMUST00000203675 246 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Vmn2r106-201ENSMUST00000167464 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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