Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Olfr397-202ENSMUST00000213134 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Igkv3-7-201ENSMUST00000103399 299 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Ang-ps3-201ENSMUST00000177964 433 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Ang-ps2-201ENSMUST00000178173 433 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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Rnf40Q3U319 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Fancb-201ENSMUST00000057150 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 AC154634.4-201ENSMUST00000226077 2665 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 9430025C20Rik-201ENSMUST00000068663 2115 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Olfr810-204ENSMUST00000217283 4527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Rnf40Q3U319 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Rnf40Q3U319 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Rnf40Q3U319 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Rnf40Q3U319 2400006E01Rik-203ENSMUST00000199633 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Rnf40Q3U319 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Mir504-201ENSMUST00000093602 79 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm21033-201ENSMUST00000208590 2608 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm9343-201ENSMUST00000209016 2609 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm37298-201ENSMUST00000193770 3868 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf40Q3U319 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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