Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm24503-201ENSMUST00000158454 135 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NfiaQ02780 Gm24636-201ENSMUST00000158673 288 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NfiaQ02780 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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NfiaQ02780 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NfiaQ02780 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NfiaQ02780 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NfiaQ02780 AC133189.1-201ENSMUST00000198820 140 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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NfiaQ02780 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NfiaQ02780 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NfiaQ02780 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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NfiaQ02780 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NfiaQ02780 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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NfiaQ02780 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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NfiaQ02780 6720489N17Rik-202ENSMUST00000201563 2640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NfiaQ02780 Cd180-201ENSMUST00000022124 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NfiaQ02780 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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NfiaQ02780 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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NfiaQ02780 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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NfiaQ02780 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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NfiaQ02780 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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NfiaQ02780 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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NfiaQ02780 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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NfiaQ02780 Gm15926-201ENSMUST00000120492 550 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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NfiaQ02780 Gm26373-201ENSMUST00000157833 103 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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NfiaQ02780 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NfiaQ02780 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NfiaQ02780 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NfiaQ02780 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NfiaQ02780 2400006E01Rik-203ENSMUST00000199633 643 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NfiaQ02780 Gm17779-201ENSMUST00000213395 394 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NfiaQ02780 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NfiaQ02780 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NfiaQ02780 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NfiaQ02780 Fat3-205ENSMUST00000217308 18760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NfiaQ02780 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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