Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Olfr136-202ENSMUST00000208525 2534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Olfr1235-ps1-201ENSMUST00000117898 314 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Olfr652-202ENSMUST00000215410 4672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm44142-201ENSMUST00000203358 311 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm23093-201ENSMUST00000083450 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Sh3bp1P55194 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms