Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm23415-201ENSMUST00000175519 83 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Hoxd10P28359 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm23269-201ENSMUST00000178701 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm26701-201ENSMUST00000181571 234 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Olfr1114-ps1-201ENSMUST00000213896 456 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.7 ms